lncRNA是一类长度大于200
nt的非编码RNA,广泛存在于各种生物体内,在表观遗传、转录以及转录后等多种水平上对生命活动进行关键性的调控,与动植物的生长发育,人类的疾病发生有着密切关系,也可作为疾病诊断的标志物或是重要靶点。
lncRNA的种类、数目太多,调控机制也异常庞杂,因此研究思路也高度多样,需要根据lncRNA的调控机制进行相应的设计,但lncRNA研究的前提,就是功能lncRNA的鉴定:发育过程、癌变前后、特定处理前后,都可能涉及lncRNA表达改变,因此lncRNA-seq就是解决此类问题的最佳工具。
lncRNA-seq是为lncRNA的鉴定、表达检测发展出来的测序方法。其技术原理,是对RNA中含量最高的rRNA进行剔除,进而通过磁珠筛选去除含量较高的小型RNA如tRNA、snRNA等,然后对剩下的所有RNA进行建库测序。