DNA甲基化、基因沉默、染色质构象变化、RNA编辑等
RIP-seq(RNA
immunoprecipitation and deep sequencing)是RNA免疫沉淀与高通量测序结合的技术,它通过免疫沉淀目标蛋白来捕获蛋白体内结合的RNA。
将捕获的RNA进行高通量测序,可获得RNA结合蛋白(RBP)在体内与众多RNA靶标的结合模式,并对其结合强度进行精确定量,最终通过分析目的蛋白在体内结合RNA的动态变化,阐述出目的蛋白对基因表达调控的分子机制。
RIP-seq的流程包括裂解细胞、富集目标RBP、回收、建库、测序、生信分析