转录组学

从RNA水平研究基因转录和表达调控规律

miRNA测序

1、技术简介

        小RNA是生物体内一类具有重要调控功能的非编码短小RNA的总称。大量研究已经证实,小RNA几乎参与调控了动植物所有的生命过程,包括细胞增殖,分化,凋亡等,并且与人类疾病的发生发展密切相关。小RNA测序正是对这一类重要的调控小RNA——特别是microRNA(miRNA)展开分析,利用高通量测序技术对样本中18~30nt的小RNA序列进行鉴定和分析。
         miRNA-seq是为检测miRNA的表达情况发展出来的高通量测序方法。
         miRNA加工过程中的Drosha、Dicer都是RNase III家族核酸酶,因此miRNA的5’为-PO4基团,3‘为-OH基团,可以直接用于连接反应。另外其长度为特征性的18-30 nt,因此通过直接对Total RNA进行连接反应,并回收插入长度在18-30nt的片段,就可以富集miRNA、建库测序,并分析miRNA的表达情况。
         miRNA加工过程中的Drosha、Dicer都是RNase III家族核酸酶,因此miRNA的5’为-PO4基团,3‘为-OH基团,可以直接用于连接反应。另外其长度为特征性的18-30 nt,因此通过直接对Total RNA进行连接反应,并回收插入长度在18-30nt的片段,就可以富集miRNA、建库测序,并分析miRNA的表达情况。

2、技术流程

3、应用方向

        1. 疾病机理研究
         2. 代谢途径研究
         3. 干细胞研究
         4. 生长发育机制研究
         5. 癌症分化与发育研究
         6. 生物标志物研究

4、部分结果展示

KEGG富集性散点图
差异基因火山图