分子/互作研究

DNA-蛋白互作、RNA-蛋白互作、蛋白-蛋白互作

RIP

1、技术简介

         RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay,RNA 结合蛋白免疫沉淀)主要是运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA 进行qPCR验证或者测序分析。
         RIP 是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具。RIP可以看成是普遍使用的染色质免疫沉淀ChIP技术的类似应用,但由于研究对象是RNA-蛋白复合物而不是DNA-蛋白复合物,RIP实验的优化条件与ChIP实验不太相同,RIP反应体系中的试剂和抗体绝对不能含有RNA酶,抗体需经RIP实验验证等等。

2、技术应用

         1.可用于研究细胞内RNA与蛋白结合情况;
         2.可用于发现RBP与非编码RNA(LncRNA、miRNA等)的相互作用;
         3.可用于绘制全基因组范围的RNA与RBP相互作用图谱。