1、技术简介

        凝胶迁移或电泳迁移率实验（EMSA-electrophoretic mobility shift assay）是分子生物学中一种应用广泛的研究DNA结合蛋白和其识别基序（motif）直接相互作用的技术，可用于定性和定量分析。这一技术最初用于蛋白-DNA互作，目前也被用于研究蛋白—RNA互作。

2、技术原理

         EMSA技术是基于DNA/蛋白质或RNA/蛋白质复合物在聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）中有不同迁移率的原理。利用DNA在凝胶电泳中朝正极迁移的速率与自身相对分子质量成正比，分子量越小，迁移速率越快，反之则迁移速度越慢。通常将纯化的蛋白或细胞粗提液和生物素标记的DNA 探针一同孵育。在非变性的聚丙烯凝胶电泳上，若蛋白质与DNA有相互作用，形成蛋白-DNA复合物，复合物的相对分子量会明显强于单DNA的，就会在电泳胶上出现相比单DNA更偏上的阻遏带。这样，从PAGE电泳结果就可以判断，该蛋白是否和特定序列结合或者该序列是否和特定蛋白结合。