全基因组甲基化测序(Whole Genome
Bisulfite Sequencing,WGBS)是通过
Bisulfite处理将基因组中未发生甲基化的C碱基进行转换用以区分具有甲基化修饰的C碱基,并结合高通量测序技术判断CpG/CHG/CHH位点是否发生甲基化的一种方法。
WGBS可以在全基因组范围内精确的检测所有单个胞嘧啶碱基(C碱基)的甲基化水平,是DNA甲基化研究的金标准。WGBS通过T4-DNA连接酶,在超声波打断基因组DNA片段的两端连接接头序列,连接产物通过重亚硫酸盐处理将未甲基化修饰的胞嘧啶C转变为尿嘧啶U,进而通过接头序列介导的
PCR 技术将尿嘧啶U转变为胸腺嘧啶T。
WGBS能为基因组DNA甲基化时空特异性修饰的研究提供重要技术支持,能广泛应用在细胞分化、组织发育、个体发育、衰老和疾病、动植物育种等生命过程的机制研究中,也是各物种甲基化图谱研究的首选方法。
1. 应用范围广:适用于所有参考基因组已知物种的甲基化研究;
2. 全基因组覆盖:最大限度地获取完整的全基因组甲基化信息,精确绘制甲基化图谱;
3. 单碱基分辨率:可精确分析每一个C碱基的甲基化状态。