宏基因组学(metagenomics),也称元基因组学,是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段,以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的微生物研究方法。
宏基因组测序(Metagenomics
Sequencing):是对环境样品中全部微生物的总DNA进行高通量测序,主要研究微生物种群结构、基因功能、微生物之间的相互协作关系以及微生物与环境之间的关系。宏基因组测序研究摆脱了微生物分离纯培养的限制,扩展了微生物资源的利用空间,为环境微生物群落的研究提供了有效工具。
1.不依赖与传统培养技术,可检测不可培养微生物物种;
2.无PCR偏好性,可检测特定生境中细菌、真菌、病毒等所有微生物;
3.不但可获得菌群物种信息,还可获得菌群的基因和功能信息;
4.与扩增子测序相比,可获得种水平,甚至菌株水平信息;
5.与扩增子测序相比,可获得种水平,甚至菌株水平信息;