DNA甲基化、基因沉默、染色质构象变化、RNA编辑等
ChIP-seq测序(CHromatin ImmunoPrecipitation and high-throughput SEQuencing)是将染色质免疫共沉淀和高通量测序相结合的技术。通过组蛋白特异性抗体,将带有特定修饰的组蛋白-DNA复合物沉淀下来,从而获取该组蛋白结合的DNA。通过对DNA进行高通量测序,即可获得该组蛋白在染色体上的分布情况。
ChIP-seq的流程包括细胞/组织交联、细胞核提取、染色质片段化、免疫共沉淀、DNA回收、文库构建、高通量测序和生信分析等一系列步骤。