m5C是RNA百余种修饰中研究较多的一种,是近年来发现一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。利用高通量测序手段验证了非编码RNA以及部分mRNA中m5C广泛存在。m5C存在于tRNA上时,可以对翻译进行调节;存在于rRNA上时,可以对核糖体的生物合成进行质控;存在于mRNA上时,则可以影响mRNA的结构、稳定性及翻译过程。
1.常规mRNA m5C甲基化测序(RNA-BS):
mRNA分离后首先通过亚硫酸盐处理,非甲基化的C转变为U,m5C修饰的碱基保持不变,结合高通量测序,可以对RNA上的每一个C碱基修饰进行定位与定量。
2.常规mRNA +lncRNA m5C甲基化测序(全转录组RNA-BS):
升级版m5C RNA甲基化测序服务,去除人rRNA后,剩余RNA经重亚硫酸盐处理后,结合高通量NGS策略,可在全转录组范围内单碱基分辨率地检测基因m5C甲基化修饰分布。