PRM(平行反应监视,parallel reaction
monitoring)是一种基于高分辨、高精度质谱的靶向蛋白质组学技术,是目前靶向蛋白质组学数据采集的主流方法,通过对特异性肽段或目标肽段(如发生翻译后修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/修饰肽段的靶向相对或绝对定量。
运用平行反应监测(PRM) 技术对蛋白进行定量时,首先利用四级杆质量分析器的选择检测能力,在一级质谱中选择性地检测目标肽段的母离子信息。随后,在collision
cell中对母离子进行碎裂;最后利用高分辨、高质量精度分析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片的信息。这样即可对复杂样本中的目标蛋白质/肽段进行准确地特异性分析。而“鸟枪法”(Shot-gun)与PRM是两种不同的质谱扫描方式。“鸟枪法”的目标是尽可能多的检测样品中的蛋白,易于检测到丰度较高蛋白,而PRM则是针对特定蛋白实现精准定量。
研究工作中涉及到蛋白或多肽定量的都可以通过PRM技术来实现。具体说来,比如验证基于基因组、转录组、定量蛋白质组等广筛获得的目标基因/蛋白,以及多肽的相对和绝对定量,想做蛋白定量却没有抗体,针对蛋白修饰位点的定量,想同时定量多个蛋白的情况等,都可以用PRM来实现其相对/ 绝对定量分析。