转录组学

从RNA水平研究基因转录和表达调控规律

mRNA测序

1、技术简介

        mRNA-seq是为检测mRNA表达、加工发展出来的高通量测序技术。

2、技术原理

        对RNA中含有polyA尾的mRNA和部分lncRNA,使用oligo dT进行富集。进而对富集下来的mRNA/lncRNA进行片段化,经过逆转录、公共测序接头连接、PCR扩增之后,得到测序文库。进而对测序结果进行生物信息学分析,从而获得RNA中的基因表达、可变剪接、RNA编辑等信息。

3、技术流程

4、部分结果展示

KEGG通路富集分析
基因表达值密度图
GO富集圈图
GO富集上下调基因差异气泡图