从RNA水平研究基因转录和表达调控规律
基因的转录后调控是一个十分复杂的精细调控网络。这其中,竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控机制最为引人关注:microRNA(miRNA)处在这个调控网络的中心,由于长非编码RNA分子通常富含miRNA结合位点,可以竞争性地结合miRNA,解除miRNA对其靶基因的抑制作用,进而调控基因的表达水平。在ceRNA机制中,circRNA和lncRNA因为常携带多个miRNA结合位点,是典型的ceRNA。
基因芯片作为一种成熟可靠的高通量实验筛选工具,是医学ceRNA研究的首选工具。
芯片的优势:芯片的探针很短,利用碱基互补配对的杂交捕获原理,进行杂交小片段,故对外泌体或者有一定降解程度的RNA能进行检测,缺点:目前市面上主要是物种人的mRNA\lncRNA\ceRNA芯片。