转录组学

从RNA水平研究基因转录和表达调控规律

5'TCR/5'BCR测序

1、技术简介

        T 细胞受体库测序(T cell receptor repertoire sequencing,TCR-Seq)是以生物信息学(Bioinformatics)全面高速分析高通量测序技术(High-throughput sequencing,HTS)检测靶向扩增后的T 细胞抗原识别决定性表面分子,即T 细胞受体(T cell receptor,TCR)多样性的检测技术,用以揭示机体在生理和病理状态下T 细胞介导的细胞免疫应答(T cell-mediated immune response)状态改变。
         BCR 测序通过高通量测序技术检测靶向扩增后的 BCR 重链和轻链,全面解析 BCR 基因重排碱基序列,以及各序列的丰度。用于研究不同B 细胞克隆的转录情况和相互间关系,从而揭示更深层次的B 细胞功能特异性,继而解释体液免疫应答耐受以及高频突变在B 细胞应答识别抗原异常等相关生命现象。

2、技术流程

3、技术优势

         1. 完整TCR/BCR检测:该技术使用5’RACE技术原理,可以获得TCR/BCR的完整序列;
         2. PCR偏好性低:该技术使用5’RACE技术原理,相较于mPCR具有更低的偏好性;
         3. 定量准确:通过引入UMI数字标签,进一步去除PCR扩增重复和测序重复、彻底排除重复引入的定量问题,准确还原TCR/BCR克隆的丰度;
         4. 无假阳性:通过引入UMI数字标签,多序列比对校正PCR和测序错误,去除假阳性TCR/BCR

4、部分结果展示

组间多样性比较
CDR3编码产物motif分析
T细胞Marker的表达情况
cloneType在单细胞转录组和TCR中的联合分布
绘制clonType亚型和转录组免疫基因相关性热图